该中心以如何将用于研究模式物种和小分子药物开发的诸多现代科技手段和药用植物资源保护及开发紧密结合为总体思路，和药植所其他中心的研究人员密切合作，积极开展基因组学、蛋白质组学、代谢组学、生态学、基于大数据与云计算的中药材物联网构建等方面的研究。另外，研究中心积极开展应用研究，近年来，开发NetCAD，CpGAVAS、PTIGS-IdIt 、DNA Barcode Tool Box等生物信息学领域软件工具，已在国内外得到广泛使用。