药植所注重提升科技创新引领能力，高水平高质量学术产出显著提升。2022年度，发表论文416篇，其中SCI论文295篇；第一作者单位发表论文321篇，其中SCI论文226篇。在Comprehensive Reviews in Food Science and Food Safety、ActaPharmaceuticaSinica B、Journal of Hazardous Materials、ACS Catalysis、Journal of Advanced Research、Journal of Controlled Release、Critical Reviews in Food Science and Nutrition、Materials Today Bio、Science of the Total Environment等国际知名期刊上发表了高水平论文。出版著作19部，其中主编《中华医学百科全书 药用植物学》、《60种中药材栽培技术》、《中药材种子质量检验方法研究》、《中国药用植物红皮书》及《中医·汉方·生药大事典》 等著作7部，对学科和行业发展有重要价值。